Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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SrpraQ9DBG7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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