Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms