Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PrameQ9D4Z5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PrameQ9D4Z5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PrameQ9D4Z5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms