Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms