Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mms19Q9D071 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Mms19Q9D071 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Mms19Q9D071 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Mms19Q9D071 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Mms19Q9D071 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Mms19Q9D071 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Mms19Q9D071 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mms19Q9D071 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Mms19Q9D071 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms