Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Efcab2Q9CQ46 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms