Protein–RNA interactions for Protein: Q91W59

Rbms1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbms1Q91W59 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rbms1Q91W59 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rbms1Q91W59 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rbms1Q91W59 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rbms1Q91W59 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rbms1Q91W59 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rbms1Q91W59 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rbms1Q91W59 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rbms1Q91W59 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rbms1Q91W59 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbms1Q91W59 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms