Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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