Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms