Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ubash3bQ8BGG7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms