Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms