Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sbno2Q7TNB8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sbno2Q7TNB8 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms