Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Trappc6aQ78XR0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Trappc6aQ78XR0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Trappc6aQ78XR0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Trappc6aQ78XR0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trappc6aQ78XR0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trappc6aQ78XR0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trappc6aQ78XR0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6aQ78XR0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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