Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms