Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms