Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms