Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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