Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Q3U6N9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Q3U6N9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Q3U6N9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Q3U6N9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Q3U6N9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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