Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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