Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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