Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms