Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptcd3Q14C51 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ptcd3Q14C51 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ptcd3Q14C51 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.2 ms