Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gpr33-201ENSMUST00000040161 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms