Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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