Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab1AP62821 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms