Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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CtdsplP58465 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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CtdsplP58465 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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CtdsplP58465 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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CtdsplP58465 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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CtdsplP58465 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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CtdsplP58465 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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CtdsplP58465 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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CtdsplP58465 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CtdsplP58465 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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CtdsplP58465 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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CtdsplP58465 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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CtdsplP58465 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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CtdsplP58465 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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CtdsplP58465 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CtdsplP58465 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms