Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Defa6P50704 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms