Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GdnfP48540 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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