Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms