Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou3f1P21952 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms