Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms