Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P20040 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P20040 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P20040 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P20040 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P20040 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P20040 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P20040 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P20040 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P20040 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P20040 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P20040 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P20040 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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