Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18526 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18526 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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