Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DffaO54786 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DffaO54786 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DffaO54786 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DffaO54786 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DffaO54786 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DffaO54786 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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