Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3542K7N6U2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3542K7N6U2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3542K7N6U2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3542K7N6U2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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