Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm6880A3KG45 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm6880A3KG45 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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