Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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RfxankQ9Z205 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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RfxankQ9Z205 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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RfxankQ9Z205 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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RfxankQ9Z205 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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RfxankQ9Z205 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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RfxankQ9Z205 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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RfxankQ9Z205 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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RfxankQ9Z205 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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RfxankQ9Z205 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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RfxankQ9Z205 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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RfxankQ9Z205 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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