Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP3

Spdef, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdefQ9WTP3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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