Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms