Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms