Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms