Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms