Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms