Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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