Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms