Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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