Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms