Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ndufb9Q9CQJ8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ndufb9Q9CQJ8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ndufb9Q9CQJ8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ndufb9Q9CQJ8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ndufb9Q9CQJ8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ndufb9Q9CQJ8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ndufb9Q9CQJ8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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