Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Rab5aQ9CQD1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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