Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Chmp3Q9CQ10 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Chmp3Q9CQ10 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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